对比研究是桥接上市药物安全有效性信息的基础，获取上市产品杂质信息的重要途径，而且通过“类比思维”还可以减少研发工作的疏漏和复杂性。如BP收载了克林霉素磷酸酯的5种杂质的化学结构，毒性相差几个数量级，国内产品生产工艺与原研厂不同（无菌灌装），多经过了剧烈的终端灭菌过程，而主药水溶液高温不稳定，杂质总量与原研厂产品相比同样较高，但具体为何种杂质，毒性如何，与原发厂产品杂质是否相同，未进行此方面对比研究，很难桥接上市产品的安全性信息，加之未进行临床试验或动物安全性试验直接上市，其安全性风险极高。

基于杂质谱分析的杂质研究是一种“以源为始”的主动思维模式，以“质量源于设计”的观点，从杂质来源入手，从制备工艺、化学结构、处方组成的分析出发，评估、预测产品中可能存在的及潜在的副产物、中间体、降解物以及试剂、催化剂残留等大体的杂质概况，辅以适当的强制降解、对照物质的加入等验证的手段，考证建立的分析方法是否能够将它们逐一检出，并进行相应的方法学验证工作；相比之下，传统的杂质研究是一种“以终为始”的被动行为和逆向思维模式，从杂质分析的结果出发，仅从建立的某种检测方法所检出的有关物质中归属其来源情况，而未充分分析与验证可能存在的潜在杂质情况，建立的分析方法能否全面检出这些杂质，故容易出现杂质漏检的情况，难以全面掌握产品的杂质谱。