原料药的生产、储存过程中可能引入杂质，其中有一类杂质能以较低水平浓度导致体内 DNA受损突变，进而引发癌症，即所谓的基因毒性杂质。因为该类杂质对患者用药安全危害性巨大，故而作为药物研发人员，充分了解基因毒性杂质，并在药物质量研究中制定基因毒性杂质控制策略是非常必要的。

基因毒性杂质的控制
基因毒性杂质总体控制思路是：“避免-清除-控制”。控制策略树如下图所示：

即首先设计合成路线时避免选用基因毒性物料、试剂及溶剂。其次，确定合成路线后，评估其中可能存在的基因毒性杂质，并根据基因毒性杂质的特性及引入的工艺位置，调整工艺参数及增加纯化工艺清除基因毒性杂质。最后开发安全的质量标准及灵敏准确的分析方法以控制残留的基因毒性杂质。



对于基因毒性杂质，首选措施是在合成路线设计时避免选用具有基因毒性的原料及试剂（如磷酸酯、卤代烷烃、烷基磺酸酯、环氧化合物、偶氮、醛类与芳香胺等具有警示结构的基因毒性化合物），选择无基因毒性杂质产生的合成路线。同时尽量避免使用存在致癌风险的溶剂（如：苯、四氯化碳、二氯乙烷、氯仿、四氢化萘、己烷、乙二醇等）。

原料药的质量控制
基于对原料药生产工艺及各过程引入的基因毒性杂质分析，制定安全的质量标准，并开发灵敏准确的分析方法，以控制残留的基因毒性杂质。