基因毒性杂质的定义
基因毒性杂质（也称遗传毒性杂质，Genotoxic Impurity，GTI）是指能直接造成DNA损伤，进而导致DNA突变，可能引发癌症的物质。
基因毒性杂质的分类
根据杂质的致癌性、基因毒性以及原料药基因毒性，可将原料药杂质大致细分为五类：1、已知基因毒性的致癌杂质；2、确认具有基因毒性但尚未确认致癌性的杂质；3、有与原料药结构无关的警示结构（如肼类、环氧化合物、N-亚硝胺类、卤代烷烃、烷基磺酸酯等），但基因毒性未知的杂质；4、有与无基因毒性原料药结构相关的警示结构的杂质；5、无警示结构或确认无基因毒性的杂质。
其中第1类和第2类为基因毒性杂质（GTI），第3类为潜在基因杂质（Potential Genotoxic Impurity，PGI），第4类和第5类为一般杂质。
潜在基因杂质是指结构中含有与基因毒性杂质反应活性相似的警示基团的化合物，通常也作为基因毒性杂质来评估。
基因毒性杂质的限度
基因毒性杂质限度的确定是特别关键的问题，目前主要有ICH M7等指导原则。基因毒性杂质限度可分为两类：有充分阈值相关机理证据（实验）的遗传毒性化合物和无充分阈值相关机理证据（实验）的遗传毒性化合物。
对于已知致癌阈值的基因毒性杂质，可根据该阈值设置每日最大允许暴露量（PDE），以此来控制该类基因毒性杂质的限度。
